ภาคสองของเรื่อง Rewrite โคทาโร่ ได้เข้าชมรมวิจัยเรื่องลึกลับแล้วชวนเพื่อนของเขาเข้าร่วมชมรมที่ประกอบด้วยนักเรียนหญิงหลายคน ชีวิตที่สนุกในโรงเรียนของโคทาโร่ต้องมาจบลง เมื่อเขาและเพื่อนต้องมาพัวพันกับชะตากรรมของโลก แล้วต้องแก้ไขในสิ่งที่ผิดพลาดเพื่อเปลี่ยนโชคชะตาของพวกเธอ